滇蛙(Rana pleuraden)分子系统地理学及保护遗传学研究
本研究通过对分布于我国云南、贵州西部、四川南部的31个采集点,共281个滇蛙(Ranapleuranden)样本的三个线粒体基因(Cytb,C01和16SrRNA)序列分析,探讨滇蛙的系统地理结构、分化状况.
联合线粒体基因(Cytb,CO(1)and16SrRNA),共获得1733bp序列(Cytb=525bp,CO(1)=723bp,16SrRNA=485bp)及78个单倍型.联合线粒体序列的系统发育分析及中介网络图显示存在5个分化较深且互为单系的族群.分子变异等级分析(analysisofmolecularvariance,AMOVA)的结果表明:单倍型中多数的遗传变异发生在地理区域组之间,为91.34%;而6.77%为地理区域组内的种群间的变异;整个种群内个体的遗传变异仅为1.89%.
研究表明分布在在中国西南地区滇蛙种群遗传结构存在一定模式.通常,有限扩散能力是导致种群之间明显的遗传分化的原因(Wongetal.,2004).研究表明:滇蛙种群的5个地理区域组之间的系统地理分化与地理障碍相关,在交界区存在一定程度的基因交流.种群历史分析揭示滇蛙种群普遍经历了多次扩张一分群事件,地理障碍与长期分化形成的生殖隔离使其维持现今的分布格局.
研究表明,滇中及北方地理(种群)区域组、滇东(种群)地理区域组、滇南(种群)地理区域组、滇西(种群)地理区域组、会里地理(种群)区域组应当归为五个管理单元,这五个地理单元应作为五个不同的进化显著性单元(evolutionarysignificantunits,ESUs)加以保护;会里种群应予以关注.
对31个采集点的281个个体测定了核基因RAG-1片段,共得到长度为498bp的238条序列,产生19个单倍型.AMOVA分析结果表明:单倍型中多数的分子变异发生在地理区域组内为48.14%,五个地理区域组间为18.83%;而种群内个体之间的变异为33.03%.由于核基因的进化速率较线粒体基因慢,本研究获得的RAG-1核基因的片段较短,获得信息量不足以反映其与地理分布格局的关系.
滇南地理(种群)区域组样本与林琴蛙(Raralili)在形态上是一致的,研究结果表明它与其它四个地理区域组的Cytb的遗传距离范围在0.025-0.067;滇南地理组与其它四个地理区域组的CO(1)基因的平均遗传距离范围为0.033-0.078;这个值属于两栖类种内遗传距离的范围(杨玉慧等,2004;Hu,2007;Tan&Wake,1995).因此,认为林琴蛙(Rlili)是滇蛙(R.pleuranden)的同物异名.
- 作者：
- 李泽君
- 学位授予单位：
- 中国科学院研究生院
- 专业名称：
- 动物学
- 授予学位：
- 博士
- 学位年度：
- 2009年
- 导师姓名：
- 杨君兴；饶定齐
- 关键词：
- 线粒体DNA；滇蛙；系统地理学；基因多样性；保护遗传学
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